课题组简介

阮珏课题组，主要研究领域为高通量测序技术下的生物信息学算法研发和应用。团队研究方向主要包括全基因组组装算法、极低频点突变检测、基因组结构变异检测、DNA存储技术、以及基因组分析技术开发。1）研发计算效率极高的三代长序列组装算法，以降低大型复杂基因组组装对计算资源的巨大需求；2）为提高结构变异的检测准确性和敏感性，开发高效算法；3）为针对性提高基因组极低频突变测序的检测效率与数据利用率，开发新型高效测序检测技术；4）实现产学研结合，将基因组学技术应用到科研项目，辅助解决重大科研问题。

课题组长阮珏，研究员，博士生导师，组学技术研究中心主任，国家优秀青年基金获得者，中国农业科学院“农科英才”，农业农村部“杰出青年农业科学家”；主要研究领域为基因组序列比对与序列组装,参与开发MAQ、SAMTools、SOAPdenovo、Pseudo-sanger、Rainbow、Novobreak、SAMRTdenovo、WTDBG等算法软件，还设计开发了Droplet-CirSeq、EasyMF、O2N-Seq等测序方法。学术论文发表在Nature、Nature Methods、Nature Genetics、Genome Research、Nature Communications、Bioinformatics等期刊，累计他引超过14,000次。（http://www.agis.org.cn/rcpy/nkyrc/zgnykxynkyctszcljrcrxzalblcl/230318.htm）

项目简介

“国家重点研发计划--新型生物纳米孔测序技术的研发及测序仪的研制”针对新型纳米孔测序电信号的特点，引入序列组成结构对碱基过孔速度影响的先验模型，泛化“分割+预测”的网络结构，扩展识别碱基的字符空间，设计出高效准确的解码算法，将新型纳米孔测序仪产出的电信号解码为终端用户可用的碱基序列。

深圳市基础研究机构“多组学算法研发”任务，以“从基因组学到表型组学”为核心设计思路，在强化基因组学算法的基础上，突破组学核心算法技术。创新复杂基因组分析技术，突破超大基因组和多倍体基因组的拼接算法，开发基于图论的结构变异检测算法、多组学数据基因注释整合算法，轻设施表型组图像识别算法等一系列组学算法技术，初步建成国际农业组学算法研发中心。

一、招聘需求

现针对以上两项任务，面向社会公开招聘1.序列分析算法研发、2.深度学习算法开发、3.测序实验方法研发，等方向的研究人员3~5名，共同参与项目开发，具体招聘条件如下：

二、岗位要求

1.本科（含）以上学历；

2.身体健康，年龄在35周岁以下；

3.熟悉掌握分析算法研发，深度学习编程，测序实验研发等技术之一；

4.满足以下条件的研究人员优先：

1）知名算法软件或实验技术主要开发者；

2）有基因组学/生物信息学背景（或经验）者；

3）有深度学习背景（或经验）者；

4）程序设计大赛获奖者；

5）独立开发较大规模程序代码者。

三、相关待遇

1.税前月薪8000~25000元，根据能力和经验面议；

2.相关社会保险公积金及其他符合人才政策的待遇按照深圳市有关规定执行；

3.其他：

1）鼓励以一作或通讯作者发表学术论文；

2）提供科研晋升通道；

四、应聘方式

请将个人简历以电子邮件形式发送到：ruanjue@caas.cn，邮件主题为“应聘+姓名+高校人才网”，个人简历应包含教育背景、工作经历、研究成果等。应聘材料请压缩成一个zip文件以附件发送。所有应聘材料我们会仔细分析并保密，一旦候选人确定后，将邀请您进行面试。

五、联系方式

阮珏：ruanjue@caas.cn、谢欣：xiexin01@caas.cn